Топология генома нейтрофилов - блог доктора Минутко

    Нейтрофилы ответственны за первую линию защиты от вторжения патогенных микроорганизмов. Их ядра уникально структурированы как множественные лепестки, которые создают сильно ограниченную ядерную среду.  Исследователи  обнаружили, что дифференцировка нейтрофилов не была связана с крупномасштабными изменениями числа и размеров топологически ассоциированных доменов (TAD). Тем не менее, нейтрофильные геномы были обогащены для дальних геномных взаимодействий, которые охватывали несколько TAD. Популяционное моделирование сферического и тороидального геномов выявило уменьшение радиусов инерции для нейтрофильных хромосом. Авторы  обнаружили, что нейтрофильные геномы были сильно обогащены гетерохроматическими геномными взаимодействиями на огромных геномных расстояниях, процесс, называемый "суперсжиманием" ( "сверхконтрактация" ) . Сверхконтрактация включала области генома, расположенные в гетерохроматическом компартменте как у предшественников, так и у нейтрофилов, или области генома, которые во время дифференцировки нейтрофилов переходили из эухроматического в гетерохроматический компартмент. Сверхконтракция сопровождалась изменением положения центромер, перицентромеров и длинных вкрапленных ядерных элементов (LINE) на нейтрофильную ядерную пластинку. Авторы  обнаружили, что экспрессия рецептора Lamin B необходима для прикрепления центромерных и перицентромерных повторов, но не элементов LINE-1 к пластинке. Дифференцирующие нейтрофилы также перемещали рибосомную ДНК и мининуклеолы в пластинку - процесс, который был тесно связан с резко сниженной экспрессией рибосомальной РНК ( Zhu Y., et.al., 2017) 

Категория сообщения в блог: 

Добавить отзыв