Уровни белка, определенные в лабораторных анализах крови, могут быть полезными косвенными показателями заболеваний. Эти биомаркеры оценивают нормальный физиологический статус, патогенные процессы или реакцию на терапию. Белки и ферменты составляют наибольшую долю лабораторных тестов, что отражает важность протеома плазмы в клинической диагностике. Типичные белковые биомаркеры, такие как ферменты аспартатаминотрансферазы (АСТ) и аланинаминотрансферазы (АЛТ) для диагностики заболеваний печени или сердечные тропонины, указывающих на некроз миокарда, обычно используются при принятии клинических решений. Ферментативная активность или лабораторные тесты на основе антител выполняются сегодня часто и при относительно низких затратах, что является уже стандартом здравоохранения. Однако специфические биомаркеры доступны только для очень ограниченного числа состояний, и большинство из них были введены несколько десятилетий назад .
Стали доступны анализы белков-связывающих веществ для одновременного количественного определения многих белков плазмы, что привело к крупномасштабным усилиям по поиску новых биомаркеров. В отличие от этих технологий протеомика на основе масс-спектрометрии (МS) становится все более мощной во всех областях исследования белков. МS измеряет масс-спектры и спектры фрагментации триптических пептидов, полученных из образца, с очень высокой точностью. Поскольку эти массы пептидов и фрагментов уникальны, протеомика на основе МS по своей природе специфична, что может быть преимуществом перед ферментными тестами и иммуноанализами. . В пределах своего предела обнаружения протеомика на основе МS может анализировать все белки в системе и в этом смысле является беспристрастной и свободной от гипотез.
Исследователи получили эталонные протеомы эритроцитов и тромбоцитов, которые на сегодняшний день являются наиболее распространенными клеточными компонентами (5 × 10 6 и 3 × 10 5 клеток на мкл). Всего было идентифицировано 6130 различных белков из 61654 пептидов с уникальной последовательностью. Протеом тромбоцитов является самым обширным (5793 белка), тогда как исследователи обнаружили 2069 белков в эритроцитах, 1682 в богатой тромбоцитами плазме и 912 в плазме без тромбоцитов.
Наиболее значительно обедненные белки после свертывания являются типичными составляющими каскада коагуляции, такими как цепи фибриногена альфа (FGA), бета (FGB) и гамма (FGG) , тогда как тромбоцитарно-ассоциированный фактор свертывания крови F13A1 и антитромбин-III (SERPINC1) снижаются более чем наполовину. Интересно, что наиболее сильно повышенными белками в сыворотке можно считать белки тромбоцитов: основной белок тромбоцитов (PPBP), альфа-цепь гликопротеина Ib тромбоцитов (GP1BA), тромбоспондин 1 (THBS1) и гликопротеин V тромбоцитов (GP5) . Всего за счет коагуляции увеличиваются 208 белков и уменьшается 91.
Добавить комментарий